Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nectin3Q9JLB9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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