Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmgn5Q9JL35 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmgn5Q9JL35 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms