Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bace2Q9JL18 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bace2Q9JL18 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bace2Q9JL18 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms