Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upk3aQ9JKX8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Upk3aQ9JKX8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms