Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrac1Q9JKP8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrac1Q9JKP8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrac1Q9JKP8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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