Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stx6Q9JKK1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stx6Q9JKK1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stx6Q9JKK1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx6Q9JKK1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx6Q9JKK1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx6Q9JKK1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Stx6Q9JKK1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stx6Q9JKK1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms