Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap4m1Q9JKC7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ap4m1Q9JKC7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms