Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ybx3Q9JKB3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ybx3Q9JKB3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ybx3Q9JKB3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Ybx3Q9JKB3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ybx3Q9JKB3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms