Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN5

Cpn1, Carboxypeptidase N catalytic chain, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpn1Q9JJN5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpn1Q9JJN5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpn1Q9JJN5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpn1Q9JJN5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms