Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Herpud1Q9JJK5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Herpud1Q9JJK5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms