Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmbr1Q9JIT0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.5 ms