Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI4

Slc13a1, Solute carrier family 13 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc13a1Q9JHI4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc13a1Q9JHI4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc13a1Q9JHI4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc13a1Q9JHI4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc13a1Q9JHI4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc13a1Q9JHI4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc13a1Q9JHI4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc13a1Q9JHI4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc13a1Q9JHI4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc13a1Q9JHI4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc13a1Q9JHI4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms