Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Timp4Q9JHB3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Timp4Q9JHB3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms