Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp29Q9ES63 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp29Q9ES63 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
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