Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc4Q9ES56 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc4Q9ES56 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.5 ms