Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr9Q9EQU3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr9Q9EQU3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tlr9Q9EQU3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr9Q9EQU3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms