Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU0

Upf1, Regulator of nonsense transcripts 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf1Q9EPU0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Upf1Q9EPU0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Upf1Q9EPU0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Upf1Q9EPU0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Upf1Q9EPU0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms