Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sil1Q9EPK6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sil1Q9EPK6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sil1Q9EPK6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sil1Q9EPK6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms