Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP97

Senp3, Sentrin-specific protease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp3Q9EP97 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Senp3Q9EP97 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Senp3Q9EP97 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Senp3Q9EP97 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Senp3Q9EP97 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Senp3Q9EP97 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms