Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsc1Q9EP53 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsc1Q9EP53 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsc1Q9EP53 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms