Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Swt1Q9DBQ9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Swt1Q9DBQ9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Swt1Q9DBQ9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Swt1Q9DBQ9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Swt1Q9DBQ9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Swt1Q9DBQ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Swt1Q9DBQ9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Swt1Q9DBQ9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Swt1Q9DBQ9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Swt1Q9DBQ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Swt1Q9DBQ9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Swt1Q9DBQ9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Swt1Q9DBQ9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Swt1Q9DBQ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Swt1Q9DBQ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Swt1Q9DBQ9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Swt1Q9DBQ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Swt1Q9DBQ9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Swt1Q9DBQ9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms