Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fundc1Q9DB70 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fundc1Q9DB70 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fundc1Q9DB70 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fundc1Q9DB70 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fundc1Q9DB70 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fundc1Q9DB70 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fundc1Q9DB70 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fundc1Q9DB70 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fundc1Q9DB70 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fundc1Q9DB70 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fundc1Q9DB70 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fundc1Q9DB70 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fundc1Q9DB70 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fundc1Q9DB70 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fundc1Q9DB70 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fundc1Q9DB70 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fundc1Q9DB70 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fundc1Q9DB70 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fundc1Q9DB70 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fundc1Q9DB70 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms