Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp5oQ9DB20 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp5oQ9DB20 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp5oQ9DB20 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp5oQ9DB20 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp5oQ9DB20 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp5oQ9DB20 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp5oQ9DB20 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp5oQ9DB20 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp5oQ9DB20 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp5oQ9DB20 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp5oQ9DB20 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp5oQ9DB20 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp5oQ9DB20 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp5oQ9DB20 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp5oQ9DB20 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp5oQ9DB20 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp5oQ9DB20 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp5oQ9DB20 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp5oQ9DB20 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms