Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB05

Napa, Alpha-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapaQ9DB05 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NapaQ9DB05 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NapaQ9DB05 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NapaQ9DB05 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NapaQ9DB05 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NapaQ9DB05 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NapaQ9DB05 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NapaQ9DB05 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms