Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx5Q9D8U8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx5Q9D8U8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.5 ms