Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tvp23bQ9D8T4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tvp23bQ9D8T4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tvp23bQ9D8T4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms