Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9D8N1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D8N1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D8N1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D8N1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D8N1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D8N1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D8N1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D8N1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9D8N1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D8N1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D8N1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D8N1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9D8N1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms