Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27,54■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27,52■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27,46■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Chmp4bQ9D8B3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27,45■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Chmp4bQ9D8B3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Chmp4bQ9D8B3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Chmp4bQ9D8B3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Chmp4bQ9D8B3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Chmp4bQ9D8B3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Chmp4bQ9D8B3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Chmp4bQ9D8B3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Chmp4bQ9D8B3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,4 ms