Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chp2Q9D869 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chp2Q9D869 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chp2Q9D869 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chp2Q9D869 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chp2Q9D869 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chp2Q9D869 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chp2Q9D869 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chp2Q9D869 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chp2Q9D869 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Chp2Q9D869 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chp2Q9D869 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Chp2Q9D869 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Chp2Q9D869 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chp2Q9D869 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chp2Q9D869 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms