Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
AplfQ9D842 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AplfQ9D842 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
AplfQ9D842 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AplfQ9D842 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AplfQ9D842 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AplfQ9D842 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
AplfQ9D842 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AplfQ9D842 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AplfQ9D842 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AplfQ9D842 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AplfQ9D842 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AplfQ9D842 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
AplfQ9D842 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AplfQ9D842 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AplfQ9D842 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AplfQ9D842 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AplfQ9D842 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AplfQ9D842 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AplfQ9D842 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
AplfQ9D842 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AplfQ9D842 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms