Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn22Q9D7U6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn22Q9D7U6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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