Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chmp5Q9D7S9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chmp5Q9D7S9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Chmp5Q9D7S9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.5 ms