Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
2310002L09RikQ9D7L5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
2310002L09RikQ9D7L5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
2310002L09RikQ9D7L5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
2310002L09RikQ9D7L5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
2310002L09RikQ9D7L5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
2310002L09RikQ9D7L5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
2310002L09RikQ9D7L5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
2310002L09RikQ9D7L5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
2310002L09RikQ9D7L5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms