Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W6

Slco6d1, MCG6225, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco6d1Q9D5W6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slco6d1Q9D5W6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slco6d1Q9D5W6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slco6d1Q9D5W6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slco6d1Q9D5W6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slco6d1Q9D5W6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slco6d1Q9D5W6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slco6d1Q9D5W6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slco6d1Q9D5W6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slco6d1Q9D5W6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slco6d1Q9D5W6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slco6d1Q9D5W6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slco6d1Q9D5W6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slco6d1Q9D5W6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slco6d1Q9D5W6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slco6d1Q9D5W6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slco6d1Q9D5W6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slco6d1Q9D5W6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slco6d1Q9D5W6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms