Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PudpQ9D5U5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PudpQ9D5U5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PudpQ9D5U5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PudpQ9D5U5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PudpQ9D5U5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PudpQ9D5U5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PudpQ9D5U5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PudpQ9D5U5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PudpQ9D5U5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PudpQ9D5U5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms