Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lpcat2bQ9D5U0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms