Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
4930449I24RikQ9D5E3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930449I24RikQ9D5E3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms