Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6v1e2Q9D593 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp6v1e2Q9D593 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6v1e2Q9D593 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms