Protein–RNA interactions for Protein: Q9D542

4930470P17Rik, RIKEN cDNA 4930470P17, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930470P17RikQ9D542 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930470P17RikQ9D542 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
4930470P17RikQ9D542 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930470P17RikQ9D542 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930470P17RikQ9D542 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms