Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul2Q9D4H8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul2Q9D4H8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms