Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rsph14Q9D3W1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rsph14Q9D3W1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rsph14Q9D3W1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms