Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Susd3Q9D176 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Susd3Q9D176 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms