Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem88Q9D0N8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem88Q9D0N8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.1 ms