Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stx17Q9D0I4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx17Q9D0I4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx17Q9D0I4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms