Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Elp3Q9CZX0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Elp3Q9CZX0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Elp3Q9CZX0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms