Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf146Q9CZW6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf146Q9CZW6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf146Q9CZW6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf146Q9CZW6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf146Q9CZW6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf146Q9CZW6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf146Q9CZW6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf146Q9CZW6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf146Q9CZW6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf146Q9CZW6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf146Q9CZW6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms