Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajc18Q9CZJ9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajc18Q9CZJ9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajc18Q9CZJ9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajc18Q9CZJ9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajc18Q9CZJ9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajc18Q9CZJ9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajc18Q9CZJ9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajc18Q9CZJ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajc18Q9CZJ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajc18Q9CZJ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajc18Q9CZJ9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajc18Q9CZJ9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajc18Q9CZJ9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajc18Q9CZJ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajc18Q9CZJ9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dnajc18Q9CZJ9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajc18Q9CZJ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms