Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH7

Mxra7, Matrix-remodeling-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mxra7Q9CZH7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mxra7Q9CZH7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mxra7Q9CZH7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mxra7Q9CZH7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mxra7Q9CZH7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.4 ms