Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thumpd2Q9CZB3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Thumpd2Q9CZB3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Thumpd2Q9CZB3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms