Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9CYI0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9CYI0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9CYI0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9CYI0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9CYI0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q9CYI0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9CYI0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9CYI0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9CYI0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9CYI0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9CYI0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9CYI0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q9CYI0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9CYI0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms